El problema lo está generando la Sway Bar. Con el agua y barro que seguramente le ha entrado, está haciendo cortocircuito y eso está afectando la electrónica. Si no te partió, es porque te está generando problemas a nivel del computador y no te está reconociendo la llave. Te recomiendo llevarlo donde José Vergara.
A mi me pasó lo mismo. El tema de la desconexión electrónica de la sway bar de los Rubicon es una buena idea, pero lamentablemente mal construida, por lo que le entra agua y, si no eres riguroso de hacer mantención regular a esa pieza (cosa que en la pauta de mantención no se indica), comienzan los problemas. Conozco varios casos a quienes les ha pasado lo mismo. Yo opté por sacar el componente electrónico y dejar la desconexión manual ... menos lío.
Esta fue la pieza que puse y me ha funcionado bastante bien. Por el precio también vale la pena. Reemplazar la sway bar original no sale nada de barato (USD 1.700 en USA) y nada te asegura que no vuelva a fallar.
http://www.quadratec.com/products/12250_0460_14.htm
Espero te sirva. Suerte...